蜂毒是一种透明液体，具有特殊的芳香气味，味苦、呈酸性反应，ph为5.0～5.5，比重为1.1313。在常温下很快就挥发干燥至原来液体重量的30%～40%，这种挥发物的成分至少含有12种以上的可用气相分析鉴定的成分，包括以乙酸异戊酯为主的报警激素，由于它在采集和精制过程中极易散失，因而通常在述及蜂毒的化学成分时被忽略。
蜂毒极易溶于水、甘油和酸，不溶于酒精。 在严格密封的条件下，即使在常温下，也能保存蜂毒的活性数年不变。2013年3月，美国科学家宣布，可以利用在蜂刺毒素中发现的化学物质毁灭艾滋病毒，防止艾滋病传播，但又不伤及周围正常细胞。